Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Plod1Q9R0E2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Plod1Q9R0E2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Plod1Q9R0E2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Plod1Q9R0E2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Plod1Q9R0E2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Plod1Q9R0E2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Plod1Q9R0E2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Plod1Q9R0E2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Plod1Q9R0E2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Plod1Q9R0E2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Plod1Q9R0E2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Plod1Q9R0E2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Plod1Q9R0E2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Plod1Q9R0E2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Plod1Q9R0E2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Plod1Q9R0E2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Plod1Q9R0E2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Plod1Q9R0E2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Plod1Q9R0E2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Plod1Q9R0E2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Plod1Q9R0E2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Plod1Q9R0E2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Plod1Q9R0E2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Plod1Q9R0E2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Plod1Q9R0E2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plod1Q9R0E2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plod1Q9R0E2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plod1Q9R0E2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plod1Q9R0E2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Plod1Q9R0E2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Plod1Q9R0E2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plod1Q9R0E2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plod1Q9R0E2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plod1Q9R0E2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plod1Q9R0E2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plod1Q9R0E2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plod1Q9R0E2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plod1Q9R0E2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Plod1Q9R0E2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Plod1Q9R0E2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Plod1Q9R0E2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Plod1Q9R0E2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Plod1Q9R0E2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Plod1Q9R0E2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Plod1Q9R0E2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Plod1Q9R0E2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms