Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHBDL2Q9NX52 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHBDL2Q9NX52 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RHBDL2Q9NX52 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms