Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI11

Stk4, Serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk4Q9JI11 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stk4Q9JI11 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stk4Q9JI11 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stk4Q9JI11 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stk4Q9JI11 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stk4Q9JI11 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stk4Q9JI11 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stk4Q9JI11 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stk4Q9JI11 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stk4Q9JI11 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stk4Q9JI11 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stk4Q9JI11 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stk4Q9JI11 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stk4Q9JI11 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stk4Q9JI11 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stk4Q9JI11 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stk4Q9JI11 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stk4Q9JI11 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stk4Q9JI11 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stk4Q9JI11 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stk4Q9JI11 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stk4Q9JI11 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stk4Q9JI11 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stk4Q9JI11 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Stk4Q9JI11 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stk4Q9JI11 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stk4Q9JI11 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stk4Q9JI11 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stk4Q9JI11 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stk4Q9JI11 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stk4Q9JI11 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stk4Q9JI11 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stk4Q9JI11 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stk4Q9JI11 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stk4Q9JI11 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stk4Q9JI11 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stk4Q9JI11 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stk4Q9JI11 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stk4Q9JI11 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stk4Q9JI11 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stk4Q9JI11 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stk4Q9JI11 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stk4Q9JI11 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stk4Q9JI11 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stk4Q9JI11 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stk4Q9JI11 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stk4Q9JI11 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stk4Q9JI11 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stk4Q9JI11 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stk4Q9JI11 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stk4Q9JI11 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stk4Q9JI11 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stk4Q9JI11 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stk4Q9JI11 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stk4Q9JI11 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stk4Q9JI11 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stk4Q9JI11 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stk4Q9JI11 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stk4Q9JI11 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stk4Q9JI11 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stk4Q9JI11 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stk4Q9JI11 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stk4Q9JI11 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stk4Q9JI11 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stk4Q9JI11 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stk4Q9JI11 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stk4Q9JI11 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stk4Q9JI11 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stk4Q9JI11 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stk4Q9JI11 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stk4Q9JI11 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Stk4Q9JI11 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Stk4Q9JI11 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stk4Q9JI11 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Stk4Q9JI11 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stk4Q9JI11 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stk4Q9JI11 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stk4Q9JI11 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stk4Q9JI11 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stk4Q9JI11 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stk4Q9JI11 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stk4Q9JI11 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stk4Q9JI11 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stk4Q9JI11 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stk4Q9JI11 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stk4Q9JI11 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stk4Q9JI11 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stk4Q9JI11 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stk4Q9JI11 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stk4Q9JI11 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stk4Q9JI11 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Stk4Q9JI11 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stk4Q9JI11 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stk4Q9JI11 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Stk4Q9JI11 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stk4Q9JI11 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stk4Q9JI11 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stk4Q9JI11 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stk4Q9JI11 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stk4Q9JI11 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms