Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAC0

Cmtm2b, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2bQ9DAC0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm2bQ9DAC0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cmtm2bQ9DAC0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm2bQ9DAC0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm2bQ9DAC0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm2bQ9DAC0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm2bQ9DAC0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm2bQ9DAC0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm2bQ9DAC0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm2bQ9DAC0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm2bQ9DAC0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm2bQ9DAC0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm2bQ9DAC0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm2bQ9DAC0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm2bQ9DAC0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm2bQ9DAC0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm2bQ9DAC0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm2bQ9DAC0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm2bQ9DAC0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm2bQ9DAC0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm2bQ9DAC0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm2bQ9DAC0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm2bQ9DAC0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm2bQ9DAC0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm2bQ9DAC0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm2bQ9DAC0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm2bQ9DAC0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm2bQ9DAC0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm2bQ9DAC0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm2bQ9DAC0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm2bQ9DAC0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmtm2bQ9DAC0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms