Protein–RNA interactions for Protein: Q9D968

Hcfc2, Host cell factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc2Q9D968 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hcfc2Q9D968 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms