Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap53Q9D439 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cfap53Q9D439 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cfap53Q9D439 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cfap53Q9D439 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cfap53Q9D439 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cfap53Q9D439 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cfap53Q9D439 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cfap53Q9D439 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cfap53Q9D439 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cfap53Q9D439 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cfap53Q9D439 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cfap53Q9D439 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms