Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tdrd12Q9CWU0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tdrd12Q9CWU0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tdrd12Q9CWU0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tdrd12Q9CWU0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms