Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Commd4Q9CQ02 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Commd4Q9CQ02 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Commd4Q9CQ02 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Commd4Q9CQ02 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Commd4Q9CQ02 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Commd4Q9CQ02 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Commd4Q9CQ02 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Commd4Q9CQ02 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms