Protein–RNA interactions for Protein: Q99M87

Dnaja3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja3Q99M87 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnaja3Q99M87 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnaja3Q99M87 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnaja3Q99M87 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnaja3Q99M87 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnaja3Q99M87 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnaja3Q99M87 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnaja3Q99M87 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnaja3Q99M87 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnaja3Q99M87 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnaja3Q99M87 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnaja3Q99M87 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnaja3Q99M87 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnaja3Q99M87 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnaja3Q99M87 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnaja3Q99M87 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnaja3Q99M87 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Dnaja3Q99M87 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnaja3Q99M87 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnaja3Q99M87 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnaja3Q99M87 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnaja3Q99M87 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnaja3Q99M87 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnaja3Q99M87 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnaja3Q99M87 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnaja3Q99M87 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnaja3Q99M87 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnaja3Q99M87 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnaja3Q99M87 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnaja3Q99M87 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnaja3Q99M87 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnaja3Q99M87 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnaja3Q99M87 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnaja3Q99M87 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnaja3Q99M87 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnaja3Q99M87 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnaja3Q99M87 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnaja3Q99M87 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnaja3Q99M87 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnaja3Q99M87 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnaja3Q99M87 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnaja3Q99M87 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnaja3Q99M87 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnaja3Q99M87 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnaja3Q99M87 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnaja3Q99M87 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnaja3Q99M87 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnaja3Q99M87 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.5 ms