Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU1

Dhdds, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Dhdds, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DhddsQ99KU1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DhddsQ99KU1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DhddsQ99KU1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DhddsQ99KU1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DhddsQ99KU1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DhddsQ99KU1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DhddsQ99KU1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DhddsQ99KU1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DhddsQ99KU1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DhddsQ99KU1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DhddsQ99KU1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DhddsQ99KU1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DhddsQ99KU1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DhddsQ99KU1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DhddsQ99KU1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DhddsQ99KU1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DhddsQ99KU1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DhddsQ99KU1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DhddsQ99KU1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DhddsQ99KU1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DhddsQ99KU1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DhddsQ99KU1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DhddsQ99KU1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DhddsQ99KU1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DhddsQ99KU1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DhddsQ99KU1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DhddsQ99KU1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DhddsQ99KU1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DhddsQ99KU1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DhddsQ99KU1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DhddsQ99KU1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DhddsQ99KU1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
DhddsQ99KU1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
DhddsQ99KU1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
DhddsQ99KU1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DhddsQ99KU1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DhddsQ99KU1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DhddsQ99KU1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DhddsQ99KU1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
DhddsQ99KU1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DhddsQ99KU1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DhddsQ99KU1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DhddsQ99KU1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DhddsQ99KU1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DhddsQ99KU1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DhddsQ99KU1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DhddsQ99KU1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DhddsQ99KU1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DhddsQ99KU1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DhddsQ99KU1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DhddsQ99KU1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DhddsQ99KU1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DhddsQ99KU1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms