Protein–RNA interactions for Protein: Q91YU3

Msantd4, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msantd4Q91YU3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msantd4Q91YU3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msantd4Q91YU3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msantd4Q91YU3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Msantd4Q91YU3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Msantd4Q91YU3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms