Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf6Q91YR7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf6Q91YR7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpf6Q91YR7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpf6Q91YR7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpf6Q91YR7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpf6Q91YR7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf6Q91YR7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf6Q91YR7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf6Q91YR7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf6Q91YR7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf6Q91YR7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf6Q91YR7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf6Q91YR7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf6Q91YR7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf6Q91YR7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prpf6Q91YR7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prpf6Q91YR7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prpf6Q91YR7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prpf6Q91YR7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prpf6Q91YR7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prpf6Q91YR7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prpf6Q91YR7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf6Q91YR7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf6Q91YR7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf6Q91YR7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf6Q91YR7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf6Q91YR7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf6Q91YR7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf6Q91YR7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf6Q91YR7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf6Q91YR7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf6Q91YR7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf6Q91YR7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf6Q91YR7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf6Q91YR7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf6Q91YR7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf6Q91YR7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpf6Q91YR7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpf6Q91YR7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpf6Q91YR7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpf6Q91YR7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpf6Q91YR7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf6Q91YR7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf6Q91YR7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf6Q91YR7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf6Q91YR7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf6Q91YR7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf6Q91YR7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf6Q91YR7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf6Q91YR7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prpf6Q91YR7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prpf6Q91YR7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prpf6Q91YR7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf6Q91YR7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf6Q91YR7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf6Q91YR7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf6Q91YR7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf6Q91YR7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf6Q91YR7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf6Q91YR7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf6Q91YR7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prpf6Q91YR7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prpf6Q91YR7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prpf6Q91YR7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Prpf6Q91YR7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms