Protein–RNA interactions for Protein: Q8K411

Pitrm1, Presequence protease, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitrm1Q8K411 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pitrm1Q8K411 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pitrm1Q8K411 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pitrm1Q8K411 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pitrm1Q8K411 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pitrm1Q8K411 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pitrm1Q8K411 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pitrm1Q8K411 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pitrm1Q8K411 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pitrm1Q8K411 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pitrm1Q8K411 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pitrm1Q8K411 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pitrm1Q8K411 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pitrm1Q8K411 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pitrm1Q8K411 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pitrm1Q8K411 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pitrm1Q8K411 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pitrm1Q8K411 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pitrm1Q8K411 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pitrm1Q8K411 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pitrm1Q8K411 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pitrm1Q8K411 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pitrm1Q8K411 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pitrm1Q8K411 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pitrm1Q8K411 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pitrm1Q8K411 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pitrm1Q8K411 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pitrm1Q8K411 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pitrm1Q8K411 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pitrm1Q8K411 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pitrm1Q8K411 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pitrm1Q8K411 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pitrm1Q8K411 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pitrm1Q8K411 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms