Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClmQ7TSN2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClmQ7TSN2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms