Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mindy1Q76LS9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mindy1Q76LS9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mindy1Q76LS9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mindy1Q76LS9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mindy1Q76LS9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Mindy1Q76LS9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mindy1Q76LS9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mindy1Q76LS9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mindy1Q76LS9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mindy1Q76LS9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mindy1Q76LS9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mindy1Q76LS9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mindy1Q76LS9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mindy1Q76LS9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mindy1Q76LS9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mindy1Q76LS9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mindy1Q76LS9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mindy1Q76LS9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mindy1Q76LS9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mindy1Q76LS9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mindy1Q76LS9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mindy1Q76LS9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mindy1Q76LS9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mindy1Q76LS9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mindy1Q76LS9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mindy1Q76LS9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mindy1Q76LS9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mindy1Q76LS9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Mindy1Q76LS9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mindy1Q76LS9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Mindy1Q76LS9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mindy1Q76LS9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mindy1Q76LS9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mindy1Q76LS9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mindy1Q76LS9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mindy1Q76LS9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mindy1Q76LS9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mindy1Q76LS9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mindy1Q76LS9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mindy1Q76LS9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mindy1Q76LS9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mindy1Q76LS9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mindy1Q76LS9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mindy1Q76LS9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Mindy1Q76LS9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mindy1Q76LS9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mindy1Q76LS9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mindy1Q76LS9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mindy1Q76LS9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms