Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Snx13Q6PHS6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snx13Q6PHS6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snx13Q6PHS6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snx13Q6PHS6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx13Q6PHS6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx13Q6PHS6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx13Q6PHS6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx13Q6PHS6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx13Q6PHS6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx13Q6PHS6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx13Q6PHS6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx13Q6PHS6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx13Q6PHS6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx13Q6PHS6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx13Q6PHS6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx13Q6PHS6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx13Q6PHS6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx13Q6PHS6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx13Q6PHS6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx13Q6PHS6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx13Q6PHS6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx13Q6PHS6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx13Q6PHS6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx13Q6PHS6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx13Q6PHS6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx13Q6PHS6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx13Q6PHS6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx13Q6PHS6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx13Q6PHS6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx13Q6PHS6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx13Q6PHS6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx13Q6PHS6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx13Q6PHS6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx13Q6PHS6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx13Q6PHS6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx13Q6PHS6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx13Q6PHS6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx13Q6PHS6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx13Q6PHS6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx13Q6PHS6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx13Q6PHS6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx13Q6PHS6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Snx13Q6PHS6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Snx13Q6PHS6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snx13Q6PHS6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snx13Q6PHS6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snx13Q6PHS6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx13Q6PHS6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx13Q6PHS6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx13Q6PHS6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx13Q6PHS6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx13Q6PHS6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx13Q6PHS6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx13Q6PHS6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx13Q6PHS6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx13Q6PHS6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx13Q6PHS6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx13Q6PHS6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx13Q6PHS6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx13Q6PHS6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx13Q6PHS6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx13Q6PHS6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx13Q6PHS6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx13Q6PHS6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx13Q6PHS6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx13Q6PHS6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms