Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF93

Pik3c3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c3Q6PF93 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pik3c3Q6PF93 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pik3c3Q6PF93 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pik3c3Q6PF93 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pik3c3Q6PF93 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pik3c3Q6PF93 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pik3c3Q6PF93 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pik3c3Q6PF93 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pik3c3Q6PF93 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pik3c3Q6PF93 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pik3c3Q6PF93 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pik3c3Q6PF93 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pik3c3Q6PF93 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pik3c3Q6PF93 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pik3c3Q6PF93 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pik3c3Q6PF93 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pik3c3Q6PF93 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pik3c3Q6PF93 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pik3c3Q6PF93 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pik3c3Q6PF93 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pik3c3Q6PF93 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pik3c3Q6PF93 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pik3c3Q6PF93 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pik3c3Q6PF93 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pik3c3Q6PF93 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pik3c3Q6PF93 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pik3c3Q6PF93 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pik3c3Q6PF93 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pik3c3Q6PF93 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pik3c3Q6PF93 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pik3c3Q6PF93 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Pik3c3Q6PF93 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Pik3c3Q6PF93 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pik3c3Q6PF93 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pik3c3Q6PF93 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pik3c3Q6PF93 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pik3c3Q6PF93 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pik3c3Q6PF93 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pik3c3Q6PF93 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pik3c3Q6PF93 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pik3c3Q6PF93 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pik3c3Q6PF93 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pik3c3Q6PF93 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pik3c3Q6PF93 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pik3c3Q6PF93 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pik3c3Q6PF93 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pik3c3Q6PF93 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pik3c3Q6PF93 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pik3c3Q6PF93 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pik3c3Q6PF93 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pik3c3Q6PF93 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Pik3c3Q6PF93 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Pik3c3Q6PF93 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pik3c3Q6PF93 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms