Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarcc2Q6PDG5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarcc2Q6PDG5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarcc2Q6PDG5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarcc2Q6PDG5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarcc2Q6PDG5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarcc2Q6PDG5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarcc2Q6PDG5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarcc2Q6PDG5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarcc2Q6PDG5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarcc2Q6PDG5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarcc2Q6PDG5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarcc2Q6PDG5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarcc2Q6PDG5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarcc2Q6PDG5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarcc2Q6PDG5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarcc2Q6PDG5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarcc2Q6PDG5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarcc2Q6PDG5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarcc2Q6PDG5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarcc2Q6PDG5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarcc2Q6PDG5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarcc2Q6PDG5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarcc2Q6PDG5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarcc2Q6PDG5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarcc2Q6PDG5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarcc2Q6PDG5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarcc2Q6PDG5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarcc2Q6PDG5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarcc2Q6PDG5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarcc2Q6PDG5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarcc2Q6PDG5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarcc2Q6PDG5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarcc2Q6PDG5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarcc2Q6PDG5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarcc2Q6PDG5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarcc2Q6PDG5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarcc2Q6PDG5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarcc2Q6PDG5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarcc2Q6PDG5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarcc2Q6PDG5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarcc2Q6PDG5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarcc2Q6PDG5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarcc2Q6PDG5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarcc2Q6PDG5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarcc2Q6PDG5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarcc2Q6PDG5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms