Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sycp1Q62209 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sycp1Q62209 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sycp1Q62209 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sycp1Q62209 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sycp1Q62209 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sycp1Q62209 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sycp1Q62209 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Sycp1Q62209 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sycp1Q62209 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sycp1Q62209 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.5 ms