Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema5bQ60519 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema5bQ60519 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema5bQ60519 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema5bQ60519 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema5bQ60519 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema5bQ60519 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sema5bQ60519 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sema5bQ60519 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sema5bQ60519 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sema5bQ60519 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sema5bQ60519 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema5bQ60519 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema5bQ60519 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema5bQ60519 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema5bQ60519 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema5bQ60519 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema5bQ60519 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema5bQ60519 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema5bQ60519 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema5bQ60519 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema5bQ60519 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema5bQ60519 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema5bQ60519 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema5bQ60519 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema5bQ60519 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema5bQ60519 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema5bQ60519 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema5bQ60519 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema5bQ60519 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema5bQ60519 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema5bQ60519 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema5bQ60519 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Sema5bQ60519 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Sema5bQ60519 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema5bQ60519 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema5bQ60519 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema5bQ60519 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema5bQ60519 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema5bQ60519 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema5bQ60519 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema5bQ60519 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema5bQ60519 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema5bQ60519 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema5bQ60519 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema5bQ60519 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema5bQ60519 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema5bQ60519 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema5bQ60519 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema5bQ60519 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema5bQ60519 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema5bQ60519 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema5bQ60519 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema5bQ60519 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema5bQ60519 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema5bQ60519 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema5bQ60519 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema5bQ60519 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema5bQ60519 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema5bQ60519 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema5bQ60519 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema5bQ60519 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema5bQ60519 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema5bQ60519 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema5bQ60519 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema5bQ60519 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema5bQ60519 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema5bQ60519 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema5bQ60519 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema5bQ60519 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema5bQ60519 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema5bQ60519 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema5bQ60519 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sema5bQ60519 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sema5bQ60519 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sema5bQ60519 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema5bQ60519 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema5bQ60519 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema5bQ60519 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema5bQ60519 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema5bQ60519 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema5bQ60519 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema5bQ60519 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema5bQ60519 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema5bQ60519 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms