Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trdv2-2Q5R1A4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms