Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC1Q15751 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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