Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 ZSWIM7-202ENST00000399280 1869 ntTSL 311□□□□□ -0.651e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 LSM2-209ENST00000470083 641 ntTSL 210.94□□□□□ -0.669e-8■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 TOP3B-210ENST00000444502 4163 ntTSL 210.86□□□□□ -0.671e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC10.83□□□□□ -0.681e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 ZNF682-203ENST00000397165 3245 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.71e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 GFOD2-202ENST00000602279 5507 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.711e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 COMMD4-203ENST00000480484 3225 ntTSL 1 (best)10.59□□□□□ -0.711e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 ZBTB14-204ENST00000582135 649 ntTSL 210.43□□□□□ -0.742e-6■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 ZSWIM7-213ENST00000495825 558 ntTSL 310.4□□□□□ -0.741e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 ZBTB14-201ENST00000357006 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.752e-6■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 DECR1-217ENST00000523447 727 ntTSL 310.3□□□□□ -0.762e-14■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 STX12-201ENST00000373943 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.761e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 MTERF4-215ENST00000476564 614 ntTSL 210.26□□□□□ -0.771e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 MTERF4-219ENST00000493169 576 ntTSL 410.26□□□□□ -0.771e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 SRRT-202ENST00000431645 397 ntTSL 210.22□□□□□ -0.771e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 EIF3I-203ENST00000471486 825 ntTSL 210.18□□□□□ -0.781e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 EIF3I-206ENST00000489353 527 ntTSL 310.17□□□□□ -0.781e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 PGC-201ENST00000356667 480 ntTSL 510.16□□□□□ -0.781e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 RFXANK-213ENST00000544923 288 ntTSL 510.15□□□□□ -0.781e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 FYTTD1-204ENST00000418169 593 ntTSL 510.11□□□□□ -0.791e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 KDM4A-201ENST00000372396 4474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.81e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 IL4R-213ENST00000565352 424 ntTSL 510.04□□□□□ -0.81e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 PARK7-209ENST00000493678 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.811e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 RUBCN-201ENST00000273582 6955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.821e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 DECR1-214ENST00000521668 520 ntTSL 59.85□□□□□ -0.832e-14■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 MTERF4-201ENST00000241527 4529 ntTSL 1 (best)9.66□□□□□ -0.861e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 BORCS7-202ENST00000369883 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.871e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 ZNF234-203ENST00000590795 663 ntTSL 39.58□□□□□ -0.881e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 SPAG5-213ENST00000581133 743 ntTSL 39.57□□□□□ -0.881e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 DECR1-213ENST00000521603 578 ntTSL 29.53□□□□□ -0.882e-14■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 MTERF4-210ENST00000449133 534 ntTSL 29.41□□□□□ -0.91e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 ZBTB14-207ENST00000614697 3341 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.922e-6■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 FYTTD1-203ENST00000415708 1342 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.931e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 TYRO3-205ENST00000560162 576 ntTSL 49.16□□□□□ -0.941e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 ZNF234-204ENST00000592437 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.951e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 DECR1-201ENST00000220764 1207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.972e-14■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 GNAI2-211ENST00000491100 3886 ntTSL 28.93□□□□□ -0.981e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 MTERF4-222ENST00000614476 4524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.991e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 MTERF4-217ENST00000480298 585 ntTSL 48.86□□□□□ -0.991e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 SPAG5-212ENST00000580682 635 ntTSL 38.73□□□□□ -1.011e-8■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 PIAS4-206ENST00000601439 235 ntTSL 38.63□□□□□ -1.031e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 RUBCN-207ENST00000467303 939 ntTSL 48.51□□□□□ -1.051e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 SLC25A51-201ENST00000242275 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.061e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 RP9-204ENST00000492391 532 ntTSL 38.26□□□□□ -1.092e-14■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 STX12-203ENST00000468761 703 ntTSL 28.26□□□□□ -1.091e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 SMG1P1-202ENST00000309865 4223 ntBASIC7.97□□□□□ -1.131e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 ZNF234-201ENST00000426739 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.141e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 ACACB-215ENST00000546328 500 ntTSL 37.84□□□□□ -1.151e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 LSM2-213ENST00000491421 820 ntTSL 37.73□□□□□ -1.179e-8■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 ANXA2-206ENST00000557904 369 ntTSL 37.63□□□□□ -1.191e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.241e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 LSM2-210ENST00000470086 713 ntTSL 27.26□□□□□ -1.259e-8■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 ZSWIM7-209ENST00000486655 726 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.271e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 KANSL1-231ENST00000639853 1425 ntTSL 57.08□□□□□ -1.281e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 FTSJ1-204ENST00000466371 736 ntTSL 27.05□□□□□ -1.288e-8■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 KANSL1-216ENST00000577114 629 ntTSL 57.03□□□□□ -1.281e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 SMG1P1-201ENST00000308347 1058 ntTSL 56.78□□□□□ -1.321e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.351e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 MTERF4-216ENST00000479205 712 ntTSL 36.48□□□□□ -1.371e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 SPAG5-204ENST00000577259 651 ntTSL 36.11□□□□□ -1.431e-8■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.462e-14■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.471e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.511e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 MTERF4-206ENST00000414146 457 ntTSL 55.31□□□□□ -1.561e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 DECR1-211ENST00000520227 864 ntTSL 55.26□□□□□ -1.572e-14■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 DECR1-212ENST00000520859 567 ntTSL 45.23□□□□□ -1.572e-14■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 DECR1-204ENST00000517597 897 ntTSL 55.03□□□□□ -1.62e-14■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.631e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 ZNF682-206ENST00000595534 603 ntTSL 34.71□□□□□ -1.661e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.671e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 BORCS7-203ENST00000478833 412 ntTSL 24.46□□□□□ -1.71e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 CEP295-204ENST00000531404 2294 ntAPPRIS ALT2 TSL 24.44□□□□□ -1.71e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 RFX7-202ENST00000559847 4165 ntTSL 1 (best)4.31□□□□□ -1.721e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 RPL6-212ENST00000553205 899 ntTSL 24.27□□□□□ -1.731e-11■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 DECR1-208ENST00000519328 816 ntTSL 1 (best)4.21□□□□□ -1.742e-14■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 ZNF682-210ENST00000599240 395 ntTSL 23.96□□□□□ -1.781e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 FYTTD1-207ENST00000428738 718 ntTSL 53.72□□□□□ -1.811e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 FYTTD1-209ENST00000494309 719 ntTSL 53.71□□□□□ -1.821e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 DECR1-205ENST00000517761 774 ntTSL 33.54□□□□□ -1.842e-14■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.851e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 ETV5-208ENST00000472868 238 ntTSL 53.01□□□□□ -1.931e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 DECR1-207ENST00000519007 762 ntTSL 32.99□□□□□ -1.932e-14■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 DECR1-206ENST00000518725 527 ntTSL 52.4□□□□□ -2.032e-14■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 ABCF3-218ENST00000498136 1014 ntTSL 215.98■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 FANCG-208ENST00000481254 592 ntTSL 39.9□□□□□ -0.827e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 FANCG-207ENST00000476212 484 ntTSL 37.77□□□□□ -1.177e-7■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 FBXL21-208ENST00000635168 2693 ntTSL 517.66■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 FBXL21-204ENST00000475169 611 ntTSL 217.56■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 FBXL21-203ENST00000472159 768 ntTSL 214.13□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 BMP1-213ENST00000521385 2320 ntTSL 1 (best)18.04■□□□□ 0.485e-9■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 BMP1-206ENST00000483364 2362 ntTSL 1 (best)17.37■□□□□ 0.375e-9■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 BMP1-214ENST00000521521 499 ntTSL 417.02■□□□□ 0.325e-9■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 BMP1-218ENST00000523849 789 ntTSL 415.81■□□□□ 0.125e-9■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 BMP1-205ENST00000471755 2695 ntTSL 1 (best)15.54■□□□□ 0.085e-9■■■■■ 52.3
EFTUD2Q15029 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.718e-11■■■■■ 52.2
EFTUD2Q15029 IQSEC1-204ENST00000613206 3582 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.268e-11■■■■■ 52.2
EFTUD2Q15029 IQSEC1-205ENST00000618604 3744 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.538e-11■■■■■ 52.2
EFTUD2Q15029 KIF7-202ENST00000445906 1375 ntTSL 1 (best)19.17■□□□□ 0.661e-6■■■■■ 52.2
Retrieved 100 of 48,698 protein–RNA pairs in 1712.3 ms