Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apoc2Q05020 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apoc2Q05020 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apoc2Q05020 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apoc2Q05020 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apoc2Q05020 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apoc2Q05020 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apoc2Q05020 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apoc2Q05020 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apoc2Q05020 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apoc2Q05020 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apoc2Q05020 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apoc2Q05020 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apoc2Q05020 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apoc2Q05020 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apoc2Q05020 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apoc2Q05020 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apoc2Q05020 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apoc2Q05020 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apoc2Q05020 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apoc2Q05020 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apoc2Q05020 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Apoc2Q05020 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apoc2Q05020 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apoc2Q05020 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apoc2Q05020 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apoc2Q05020 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apoc2Q05020 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apoc2Q05020 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apoc2Q05020 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apoc2Q05020 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apoc2Q05020 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apoc2Q05020 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apoc2Q05020 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apoc2Q05020 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apoc2Q05020 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apoc2Q05020 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apoc2Q05020 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apoc2Q05020 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apoc2Q05020 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apoc2Q05020 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apoc2Q05020 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apoc2Q05020 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apoc2Q05020 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apoc2Q05020 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Apoc2Q05020 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoc2Q05020 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms