Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RelaQ04207 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RelaQ04207 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RelaQ04207 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RelaQ04207 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RelaQ04207 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RelaQ04207 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RelaQ04207 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RelaQ04207 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RelaQ04207 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RelaQ04207 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RelaQ04207 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RelaQ04207 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RelaQ04207 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RelaQ04207 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RelaQ04207 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RelaQ04207 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RelaQ04207 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RelaQ04207 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RelaQ04207 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RelaQ04207 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RelaQ04207 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RelaQ04207 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RelaQ04207 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RelaQ04207 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RelaQ04207 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RelaQ04207 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RelaQ04207 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RelaQ04207 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RelaQ04207 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RelaQ04207 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RelaQ04207 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RelaQ04207 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RelaQ04207 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RelaQ04207 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RelaQ04207 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RelaQ04207 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RelaQ04207 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RelaQ04207 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RelaQ04207 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RelaQ04207 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RelaQ04207 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RelaQ04207 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RelaQ04207 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RelaQ04207 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RelaQ04207 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RelaQ04207 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RelaQ04207 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RelaQ04207 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RelaQ04207 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RelaQ04207 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RelaQ04207 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RelaQ04207 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RelaQ04207 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RelaQ04207 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RelaQ04207 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RelaQ04207 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RelaQ04207 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RelaQ04207 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RelaQ04207 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RelaQ04207 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RelaQ04207 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RelaQ04207 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RelaQ04207 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RelaQ04207 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RelaQ04207 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RelaQ04207 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RelaQ04207 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RelaQ04207 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RelaQ04207 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RelaQ04207 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RelaQ04207 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RelaQ04207 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RelaQ04207 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RelaQ04207 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RelaQ04207 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RelaQ04207 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RelaQ04207 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RelaQ04207 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RelaQ04207 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RelaQ04207 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RelaQ04207 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RelaQ04207 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RelaQ04207 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RelaQ04207 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RelaQ04207 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RelaQ04207 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RelaQ04207 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RelaQ04207 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RelaQ04207 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RelaQ04207 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RelaQ04207 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms