Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Thbs2Q03350 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Thbs2Q03350 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Thbs2Q03350 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Thbs2Q03350 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Thbs2Q03350 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Thbs2Q03350 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Thbs2Q03350 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Thbs2Q03350 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Thbs2Q03350 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Thbs2Q03350 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Thbs2Q03350 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Thbs2Q03350 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Thbs2Q03350 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Thbs2Q03350 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Thbs2Q03350 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Thbs2Q03350 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Thbs2Q03350 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Thbs2Q03350 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Thbs2Q03350 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Thbs2Q03350 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Thbs2Q03350 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Thbs2Q03350 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Thbs2Q03350 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Thbs2Q03350 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Thbs2Q03350 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Thbs2Q03350 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Thbs2Q03350 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Thbs2Q03350 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Thbs2Q03350 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Thbs2Q03350 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Thbs2Q03350 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Thbs2Q03350 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Thbs2Q03350 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Thbs2Q03350 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Thbs2Q03350 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Thbs2Q03350 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Thbs2Q03350 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Thbs2Q03350 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Thbs2Q03350 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Thbs2Q03350 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Thbs2Q03350 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Thbs2Q03350 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Thbs2Q03350 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms