Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GscQ02591 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GscQ02591 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GscQ02591 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GscQ02591 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GscQ02591 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GscQ02591 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GscQ02591 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GscQ02591 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GscQ02591 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GscQ02591 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GscQ02591 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GscQ02591 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GscQ02591 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GscQ02591 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GscQ02591 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GscQ02591 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GscQ02591 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GscQ02591 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GscQ02591 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GscQ02591 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GscQ02591 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GscQ02591 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GscQ02591 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GscQ02591 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GscQ02591 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GscQ02591 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GscQ02591 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GscQ02591 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GscQ02591 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GscQ02591 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GscQ02591 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GscQ02591 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GscQ02591 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GscQ02591 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GscQ02591 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GscQ02591 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GscQ02591 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GscQ02591 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GscQ02591 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GscQ02591 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GscQ02591 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GscQ02591 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GscQ02591 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GscQ02591 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GscQ02591 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GscQ02591 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GscQ02591 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GscQ02591 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GscQ02591 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GscQ02591 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GscQ02591 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GscQ02591 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GscQ02591 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GscQ02591 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GscQ02591 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GscQ02591 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GscQ02591 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GscQ02591 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GscQ02591 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GscQ02591 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GscQ02591 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GscQ02591 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GscQ02591 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GscQ02591 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GscQ02591 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GscQ02591 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GscQ02591 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GscQ02591 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GscQ02591 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GscQ02591 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GscQ02591 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GscQ02591 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GscQ02591 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GscQ02591 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GscQ02591 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GscQ02591 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GscQ02591 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GscQ02591 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GscQ02591 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GscQ02591 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GscQ02591 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GscQ02591 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GscQ02591 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GscQ02591 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GscQ02591 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GscQ02591 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GscQ02591 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GscQ02591 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GscQ02591 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GscQ02591 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GscQ02591 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GscQ02591 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GscQ02591 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GscQ02591 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GscQ02591 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GscQ02591 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GscQ02591 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GscQ02591 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GscQ02591 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms