Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps29P62274 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps29P62274 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps29P62274 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps29P62274 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rps29P62274 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps29P62274 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps29P62274 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rps29P62274 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms