Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 SET5YHR207C 1581 nt5.77□□□□□ -1.49
SHQ1P40486 CAD1YDR423C 1230 nt5.77□□□□□ -1.49
SHQ1P40486 YIR007WYIR007W 2295 nt5.77□□□□□ -1.49
SHQ1P40486 ALT1YLR089C 1779 nt5.76□□□□□ -1.49
SHQ1P40486 YJR115WYJR115W 510 nt5.76□□□□□ -1.49
SHQ1P40486 ROX3YBL093C 663 nt5.76□□□□□ -1.49
SHQ1P40486 STE50YCL032W 1041 nt5.76□□□□□ -1.49
SHQ1P40486 DFG5YMR238W 1377 nt5.76□□□□□ -1.49
SHQ1P40486 NRD1YNL251C 1728 nt5.76□□□□□ -1.49
SHQ1P40486 TIM54YJL054W 1437 nt5.75□□□□□ -1.49
SHQ1P40486 SIT1YEL065W 1887 nt5.75□□□□□ -1.49
SHQ1P40486 RHO4YKR055W 876 nt5.75□□□□□ -1.49
SHQ1P40486 YLR296WYLR296W 327 nt5.75□□□□□ -1.49
SHQ1P40486 RPS19BYNL302C 435 nt5.75□□□□□ -1.49
SHQ1P40486 TEA1YOR337W 2280 nt5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P40486 KNH1YDL049C 807 nt5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P40486 YGR182CYGR182C 354 nt5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P40486 MRPL13YKR006C 795 nt5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P40486 YOR024WYOR024W 324 nt5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P40486 SEC18YBR080C 2277 nt5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P40486 GUP2YPL189W 1830 nt5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P40486 SOG2YOR353C 2376 nt5.73□□□□□ -1.49
SHQ1P40486 BPL1YDL141W 2073 nt5.73□□□□□ -1.49
SHQ1P40486 RMA1YKL132C 1293 nt5.73□□□□□ -1.49
SHQ1P40486 YKL151CYKL151C 1014 nt5.73□□□□□ -1.49
SHQ1P40486 GPM3YOL056W 912 nt5.73□□□□□ -1.49
SHQ1P40486 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt5.73□□□□□ -1.49
SHQ1P40486 KIP2YPL155C 2121 nt5.73□□□□□ -1.49
SHQ1P40486 RNR3YIL066C 2610 nt5.73□□□□□ -1.49
SHQ1P40486 ULA1YPL003W 1389 nt5.72□□□□□ -1.49
SHQ1P40486 YJL193WYJL193W 1209 nt5.72□□□□□ -1.49
SHQ1P40486 YLR194CYLR194C 765 nt5.72□□□□□ -1.49
SHQ1P40486 SCO1YBR037C 888 nt5.72□□□□□ -1.49
SHQ1P40486 ATG7YHR171W 1893 nt5.72□□□□□ -1.49
SHQ1P40486 ATE1YGL017W 1512 nt5.72□□□□□ -1.49
SHQ1P40486 ADE13YLR359W 1449 nt5.72□□□□□ -1.49
SHQ1P40486 UTP9YHR196W 1728 nt5.71□□□□□ -1.49
SHQ1P40486 BNA5YLR231C 1362 nt5.71□□□□□ -1.5
SHQ1P40486 BIT2YBR270C 1638 nt5.71□□□□□ -1.5
SHQ1P40486 CBC2YPL178W 627 nt5.71□□□□□ -1.5
SHQ1P40486 FLC3YGL139W 2409 nt5.71□□□□□ -1.5
SHQ1P40486 VMA13YPR036W 1437 nt5.71□□□□□ -1.5
SHQ1P40486 SYG1YIL047C 2709 nt5.7□□□□□ -1.5
SHQ1P40486 CTS1YLR286C 1689 nt5.7□□□□□ -1.5
SHQ1P40486 YJL107CYJL107C 1164 nt5.7□□□□□ -1.5
SHQ1P40486 PNP1YLR209C 936 nt5.7□□□□□ -1.5
SHQ1P40486 RPA49YNL248C 1248 nt5.7□□□□□ -1.5
SHQ1P40486 HSP26YBR072W 645 nt5.7□□□□□ -1.5
SHQ1P40486 TOS4YLR183C 1470 nt5.7□□□□□ -1.5
SHQ1P40486 ERG7YHR072W 2196 nt5.69□□□□□ -1.5
SHQ1P40486 SLO1YER180C-A 258 nt5.69□□□□□ -1.5
SHQ1P40486 IPI1YHR085W 1005 nt5.69□□□□□ -1.5
SHQ1P40486 GAT4YIR013C 366 nt5.69□□□□□ -1.5
SHQ1P40486 MPM1YJL066C 759 nt5.69□□□□□ -1.5
SHQ1P40486 AVO1YOL078W 3531 nt5.69□□□□□ -1.5
SHQ1P40486 ATG20YDL113C 1923 nt5.69□□□□□ -1.5
SHQ1P40486 MHR1YDR296W 681 nt5.68□□□□□ -1.5
SHQ1P40486 COG1YGL223C 1254 nt5.68□□□□□ -1.5
SHQ1P40486 SCW4YGR279C 1161 nt5.68□□□□□ -1.5
SHQ1P40486 PRS1YKL181W 1284 nt5.68□□□□□ -1.5
SHQ1P40486 RPL21BYPL079W 483 nt5.68□□□□□ -1.5
SHQ1P40486 YCL041CYCL041C 495 nt5.68□□□□□ -1.5
SHQ1P40486 SLT2YHR030C 1455 nt5.68□□□□□ -1.5
SHQ1P40486 XPT1YJR133W 630 nt5.67□□□□□ -1.5
SHQ1P40486 LDB18YLL049W 540 nt5.67□□□□□ -1.5
SHQ1P40486 ERG3YLR056W 1098 nt5.67□□□□□ -1.5
SHQ1P40486 YNL108CYNL108C 813 nt5.67□□□□□ -1.5
SHQ1P40486 YJR015WYJR015W 1533 nt5.67□□□□□ -1.5
SHQ1P40486 VBA1YMR088C 1689 nt5.66□□□□□ -1.5
SHQ1P40486 RGT1YKL038W 3513 nt5.66□□□□□ -1.5
SHQ1P40486 YDR401WYDR401W 564 nt5.66□□□□□ -1.5
SHQ1P40486 YJL171CYJL171C 1191 nt5.66□□□□□ -1.5
SHQ1P40486 COX17YLL009C 210 nt5.66□□□□□ -1.5
SHQ1P40486 AAP1YHR047C 2571 nt5.66□□□□□ -1.5
SHQ1P40486 HES1YOR237W 1305 nt5.66□□□□□ -1.5
SHQ1P40486 RML2YEL050C 1182 nt5.65□□□□□ -1.5
SHQ1P40486 PRO3YER023W 861 nt5.65□□□□□ -1.5
SHQ1P40486 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt5.65□□□□□ -1.5
SHQ1P40486 PRM10YJL108C 1152 nt5.65□□□□□ -1.5
SHQ1P40486 ISU2YOR226C 471 nt5.65□□□□□ -1.5
SHQ1P40486 NOB1YOR056C 1380 nt5.65□□□□□ -1.51
SHQ1P40486 UBX2YML013W 1755 nt5.65□□□□□ -1.51
SHQ1P40486 RPT6YGL048C 1218 nt5.64□□□□□ -1.51
SHQ1P40486 TDH3YGR192C 999 nt5.64□□□□□ -1.51
SHQ1P40486 SEC13YLR208W 894 nt5.64□□□□□ -1.51
SHQ1P40486 ECM3YOR092W 1842 nt5.64□□□□□ -1.51
SHQ1P40486 EIS1YMR031C 2532 nt5.64□□□□□ -1.51
SHQ1P40486 MMP1YLL061W 1752 nt5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P40486 UTR4YEL038W 684 nt5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P40486 snR10snR10 245 nt5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P40486 CPA1YOR303W 1236 nt5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P40486 YOR318CYOR318C 306 nt5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P40486 SAM4YPL273W 978 nt5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P40486 KTR3YBR205W 1215 nt5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P40486 PDB1YBR221C 1101 nt5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P40486 DCC1YCL016C 1143 nt5.63□□□□□ -1.51
SHQ1P40486 HAP1YLR256W 4509 nt5.62□□□□□ -1.51
SHQ1P40486 GET3YDL100C 1065 nt5.62□□□□□ -1.51
SHQ1P40486 CUE2YKL090W 1332 nt5.62□□□□□ -1.51
SHQ1P40486 HOS1YPR068C 1413 nt5.62□□□□□ -1.51
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