Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lef1P27782 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lef1P27782 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lef1P27782 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lef1P27782 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lef1P27782 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lef1P27782 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lef1P27782 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lef1P27782 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lef1P27782 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms