Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifna4P07351 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ifna4P07351 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ifna4P07351 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifna4P07351 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifna4P07351 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifna4P07351 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifna4P07351 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifna4P07351 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifna4P07351 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifna4P07351 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifna4P07351 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifna4P07351 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifna4P07351 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifna4P07351 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifna4P07351 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifna4P07351 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifna4P07351 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifna4P07351 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifna4P07351 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifna4P07351 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifna4P07351 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifna4P07351 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifna4P07351 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifna4P07351 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifna4P07351 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifna4P07351 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifna4P07351 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifna4P07351 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifna4P07351 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifna4P07351 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifna4P07351 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifna4P07351 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifna4P07351 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifna4P07351 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifna4P07351 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifna4P07351 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifna4P07351 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms