Protein–RNA interactions for Protein: P04919

Slc4a1, Band 3 anion transport protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a1P04919 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc4a1P04919 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc4a1P04919 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc4a1P04919 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc4a1P04919 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc4a1P04919 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc4a1P04919 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc4a1P04919 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc4a1P04919 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc4a1P04919 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc4a1P04919 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc4a1P04919 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc4a1P04919 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc4a1P04919 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc4a1P04919 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc4a1P04919 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc4a1P04919 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc4a1P04919 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc4a1P04919 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc4a1P04919 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc4a1P04919 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc4a1P04919 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc4a1P04919 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc4a1P04919 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc4a1P04919 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc4a1P04919 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc4a1P04919 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc4a1P04919 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Slc4a1P04919 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Slc4a1P04919 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc4a1P04919 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc4a1P04919 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc4a1P04919 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc4a1P04919 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc4a1P04919 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc4a1P04919 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc4a1P04919 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc4a1P04919 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc4a1P04919 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc4a1P04919 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc4a1P04919 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc4a1P04919 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc4a1P04919 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc4a1P04919 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc4a1P04919 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc4a1P04919 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc4a1P04919 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc4a1P04919 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc4a1P04919 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc4a1P04919 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc4a1P04919 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc4a1P04919 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc4a1P04919 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc4a1P04919 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc4a1P04919 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc4a1P04919 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Slc4a1P04919 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc4a1P04919 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc4a1P04919 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc4a1P04919 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc4a1P04919 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc4a1P04919 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc4a1P04919 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc4a1P04919 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc4a1P04919 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc4a1P04919 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc4a1P04919 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc4a1P04919 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc4a1P04919 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc4a1P04919 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc4a1P04919 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc4a1P04919 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc4a1P04919 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc4a1P04919 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc4a1P04919 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc4a1P04919 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc4a1P04919 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc4a1P04919 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc4a1P04919 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc4a1P04919 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc4a1P04919 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc4a1P04919 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc4a1P04919 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc4a1P04919 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc4a1P04919 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc4a1P04919 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc4a1P04919 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc4a1P04919 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc4a1P04919 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc4a1P04919 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc4a1P04919 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc4a1P04919 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc4a1P04919 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc4a1P04919 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc4a1P04919 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc4a1P04919 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc4a1P04919 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc4a1P04919 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc4a1P04919 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc4a1P04919 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms