Protein–RNA interactions for Protein: P02535

Krt10, Keratin, type I cytoskeletal 10, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt10P02535 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt10P02535 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Krt10P02535 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt10P02535 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt10P02535 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt10P02535 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt10P02535 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt10P02535 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt10P02535 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt10P02535 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt10P02535 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt10P02535 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt10P02535 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt10P02535 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt10P02535 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt10P02535 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt10P02535 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt10P02535 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt10P02535 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt10P02535 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt10P02535 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt10P02535 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt10P02535 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt10P02535 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt10P02535 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt10P02535 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt10P02535 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Krt10P02535 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt10P02535 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt10P02535 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt10P02535 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt10P02535 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt10P02535 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt10P02535 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt10P02535 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt10P02535 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt10P02535 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt10P02535 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt10P02535 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt10P02535 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt10P02535 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt10P02535 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt10P02535 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt10P02535 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Krt10P02535 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Krt10P02535 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Krt10P02535 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt10P02535 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Krt10P02535 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt10P02535 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Krt10P02535 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Krt10P02535 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Krt10P02535 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt10P02535 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt10P02535 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt10P02535 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt10P02535 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt10P02535 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt10P02535 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt10P02535 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt10P02535 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt10P02535 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt10P02535 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt10P02535 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt10P02535 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt10P02535 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt10P02535 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt10P02535 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt10P02535 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt10P02535 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt10P02535 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt10P02535 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt10P02535 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt10P02535 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt10P02535 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt10P02535 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt10P02535 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt10P02535 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt10P02535 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt10P02535 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt10P02535 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt10P02535 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt10P02535 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt10P02535 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt10P02535 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt10P02535 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt10P02535 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt10P02535 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt10P02535 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt10P02535 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt10P02535 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt10P02535 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt10P02535 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt10P02535 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms