Protein–RNA interactions for Protein: O88351

Ikbkb, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IkbkbO88351 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IkbkbO88351 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IkbkbO88351 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IkbkbO88351 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IkbkbO88351 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IkbkbO88351 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IkbkbO88351 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IkbkbO88351 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IkbkbO88351 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IkbkbO88351 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IkbkbO88351 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IkbkbO88351 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IkbkbO88351 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IkbkbO88351 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IkbkbO88351 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IkbkbO88351 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IkbkbO88351 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IkbkbO88351 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IkbkbO88351 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IkbkbO88351 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IkbkbO88351 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IkbkbO88351 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IkbkbO88351 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IkbkbO88351 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IkbkbO88351 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IkbkbO88351 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IkbkbO88351 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IkbkbO88351 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IkbkbO88351 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IkbkbO88351 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IkbkbO88351 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IkbkbO88351 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IkbkbO88351 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IkbkbO88351 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IkbkbO88351 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IkbkbO88351 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IkbkbO88351 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IkbkbO88351 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IkbkbO88351 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IkbkbO88351 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IkbkbO88351 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IkbkbO88351 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IkbkbO88351 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IkbkbO88351 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IkbkbO88351 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IkbkbO88351 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IkbkbO88351 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IkbkbO88351 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IkbkbO88351 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IkbkbO88351 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IkbkbO88351 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IkbkbO88351 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IkbkbO88351 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IkbkbO88351 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IkbkbO88351 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IkbkbO88351 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms