Protein–RNA interactions for Protein: O55241

Hcrt, Orexin, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HcrtO55241 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HcrtO55241 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HcrtO55241 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HcrtO55241 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HcrtO55241 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HcrtO55241 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HcrtO55241 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HcrtO55241 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HcrtO55241 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HcrtO55241 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HcrtO55241 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HcrtO55241 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HcrtO55241 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HcrtO55241 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HcrtO55241 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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HcrtO55241 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HcrtO55241 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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HcrtO55241 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HcrtO55241 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HcrtO55241 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HcrtO55241 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HcrtO55241 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HcrtO55241 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HcrtO55241 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HcrtO55241 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HcrtO55241 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HcrtO55241 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HcrtO55241 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HcrtO55241 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HcrtO55241 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HcrtO55241 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HcrtO55241 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HcrtO55241 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
HcrtO55241 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HcrtO55241 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HcrtO55241 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HcrtO55241 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HcrtO55241 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HcrtO55241 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HcrtO55241 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HcrtO55241 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HcrtO55241 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HcrtO55241 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HcrtO55241 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HcrtO55241 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HcrtO55241 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms