Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cbx4O55187 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cbx4O55187 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cbx4O55187 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cbx4O55187 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cbx4O55187 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cbx4O55187 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cbx4O55187 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cbx4O55187 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cbx4O55187 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cbx4O55187 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cbx4O55187 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cbx4O55187 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cbx4O55187 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cbx4O55187 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cbx4O55187 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cbx4O55187 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx4O55187 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cbx4O55187 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx4O55187 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx4O55187 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx4O55187 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx4O55187 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx4O55187 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cbx4O55187 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cbx4O55187 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cbx4O55187 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cbx4O55187 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cbx4O55187 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cbx4O55187 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cbx4O55187 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cbx4O55187 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cbx4O55187 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cbx4O55187 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cbx4O55187 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx4O55187 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx4O55187 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx4O55187 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx4O55187 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx4O55187 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx4O55187 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cbx4O55187 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cbx4O55187 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cbx4O55187 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cbx4O55187 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cbx4O55187 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx4O55187 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx4O55187 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx4O55187 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms