Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrxO54751 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrxO54751 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrxO54751 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CrxO54751 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CrxO54751 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrxO54751 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrxO54751 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrxO54751 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrxO54751 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CrxO54751 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CrxO54751 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CrxO54751 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrxO54751 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrxO54751 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrxO54751 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrxO54751 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrxO54751 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CrxO54751 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrxO54751 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrxO54751 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrxO54751 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrxO54751 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrxO54751 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrxO54751 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CrxO54751 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CrxO54751 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrxO54751 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrxO54751 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrxO54751 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrxO54751 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrxO54751 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrxO54751 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrxO54751 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrxO54751 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrxO54751 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrxO54751 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrxO54751 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrxO54751 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrxO54751 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrxO54751 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrxO54751 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrxO54751 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrxO54751 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrxO54751 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrxO54751 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrxO54751 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrxO54751 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CrxO54751 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CrxO54751 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CrxO54751 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrxO54751 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrxO54751 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CrxO54751 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrxO54751 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrxO54751 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrxO54751 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrxO54751 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrxO54751 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrxO54751 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrxO54751 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CrxO54751 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrxO54751 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrxO54751 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrxO54751 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrxO54751 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrxO54751 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrxO54751 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrxO54751 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrxO54751 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrxO54751 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrxO54751 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrxO54751 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrxO54751 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrxO54751 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrxO54751 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrxO54751 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrxO54751 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrxO54751 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrxO54751 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrxO54751 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CrxO54751 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrxO54751 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrxO54751 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrxO54751 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrxO54751 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrxO54751 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrxO54751 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrxO54751 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrxO54751 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrxO54751 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrxO54751 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrxO54751 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrxO54751 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrxO54751 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrxO54751 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CrxO54751 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrxO54751 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrxO54751 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrxO54751 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms