Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34c2J3QNM1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34c2J3QNM1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34c2J3QNM1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34c2J3QNM1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34c2J3QNM1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34c2J3QNM1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34c2J3QNM1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34c2J3QNM1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34c2J3QNM1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34c2J3QNM1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn34c2J3QNM1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cldn34c2J3QNM1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34c2J3QNM1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34c2J3QNM1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34c2J3QNM1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34c2J3QNM1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34c2J3QNM1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34c2J3QNM1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34c2J3QNM1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34c2J3QNM1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34c2J3QNM1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34c2J3QNM1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34c2J3QNM1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34c2J3QNM1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34c2J3QNM1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34c2J3QNM1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34c2J3QNM1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34c2J3QNM1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34c2J3QNM1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34c2J3QNM1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34c2J3QNM1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34c2J3QNM1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34c2J3QNM1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34c2J3QNM1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34c2J3QNM1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34c2J3QNM1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34c2J3QNM1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34c2J3QNM1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34c2J3QNM1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34c2J3QNM1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34c2J3QNM1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34c2J3QNM1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34c2J3QNM1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34c2J3QNM1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34c2J3QNM1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34c2J3QNM1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34c2J3QNM1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34c2J3QNM1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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