Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zscan5bB2RTN3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Zscan5bB2RTN3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Zscan5bB2RTN3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Zscan5bB2RTN3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zscan5bB2RTN3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zscan5bB2RTN3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zscan5bB2RTN3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zscan5bB2RTN3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zscan5bB2RTN3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zscan5bB2RTN3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zscan5bB2RTN3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zscan5bB2RTN3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zscan5bB2RTN3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Zscan5bB2RTN3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zscan5bB2RTN3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zscan5bB2RTN3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zscan5bB2RTN3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Zscan5bB2RTN3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zscan5bB2RTN3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zscan5bB2RTN3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zscan5bB2RTN3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zscan5bB2RTN3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zscan5bB2RTN3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zscan5bB2RTN3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zscan5bB2RTN3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zscan5bB2RTN3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zscan5bB2RTN3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zscan5bB2RTN3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Zscan5bB2RTN3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zscan5bB2RTN3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zscan5bB2RTN3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zscan5bB2RTN3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zscan5bB2RTN3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zscan5bB2RTN3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zscan5bB2RTN3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zscan5bB2RTN3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zscan5bB2RTN3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zscan5bB2RTN3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zscan5bB2RTN3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zscan5bB2RTN3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zscan5bB2RTN3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zscan5bB2RTN3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zscan5bB2RTN3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zscan5bB2RTN3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zscan5bB2RTN3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Zscan5bB2RTN3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zscan5bB2RTN3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zscan5bB2RTN3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zscan5bB2RTN3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zscan5bB2RTN3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zscan5bB2RTN3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zscan5bB2RTN3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zscan5bB2RTN3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zscan5bB2RTN3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms