Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn1aA2APX8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn1aA2APX8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn1aA2APX8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn1aA2APX8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn1aA2APX8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn1aA2APX8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn1aA2APX8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn1aA2APX8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn1aA2APX8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn1aA2APX8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn1aA2APX8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn1aA2APX8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn1aA2APX8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn1aA2APX8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn1aA2APX8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn1aA2APX8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn1aA2APX8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scn1aA2APX8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scn1aA2APX8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scn1aA2APX8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scn1aA2APX8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn1aA2APX8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn1aA2APX8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn1aA2APX8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn1aA2APX8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn1aA2APX8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scn1aA2APX8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scn1aA2APX8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scn1aA2APX8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scn1aA2APX8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scn1aA2APX8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scn1aA2APX8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Scn1aA2APX8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scn1aA2APX8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scn1aA2APX8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scn1aA2APX8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scn1aA2APX8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scn1aA2APX8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scn1aA2APX8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scn1aA2APX8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Scn1aA2APX8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scn1aA2APX8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scn1aA2APX8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scn1aA2APX8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scn1aA2APX8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scn1aA2APX8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scn1aA2APX8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scn1aA2APX8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scn1aA2APX8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scn1aA2APX8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scn1aA2APX8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scn1aA2APX8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scn1aA2APX8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms