Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cul4bA2A432 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cul4bA2A432 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cul4bA2A432 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cul4bA2A432 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cul4bA2A432 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cul4bA2A432 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cul4bA2A432 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cul4bA2A432 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cul4bA2A432 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cul4bA2A432 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cul4bA2A432 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cul4bA2A432 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cul4bA2A432 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cul4bA2A432 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cul4bA2A432 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cul4bA2A432 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cul4bA2A432 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cul4bA2A432 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cul4bA2A432 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cul4bA2A432 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cul4bA2A432 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cul4bA2A432 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cul4bA2A432 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cul4bA2A432 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cul4bA2A432 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cul4bA2A432 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cul4bA2A432 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cul4bA2A432 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cul4bA2A432 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cul4bA2A432 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cul4bA2A432 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cul4bA2A432 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cul4bA2A432 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cul4bA2A432 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cul4bA2A432 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cul4bA2A432 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cul4bA2A432 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cul4bA2A432 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cul4bA2A432 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cul4bA2A432 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cul4bA2A432 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cul4bA2A432 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cul4bA2A432 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cul4bA2A432 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cul4bA2A432 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cul4bA2A432 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cul4bA2A432 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cul4bA2A432 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cul4bA2A432 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cul4bA2A432 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cul4bA2A432 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cul4bA2A432 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cul4bA2A432 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cul4bA2A432 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cul4bA2A432 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cul4bA2A432 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cul4bA2A432 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cul4bA2A432 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cul4bA2A432 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Cul4bA2A432 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cul4bA2A432 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cul4bA2A432 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cul4bA2A432 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cul4bA2A432 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cul4bA2A432 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cul4bA2A432 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cul4bA2A432 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cul4bA2A432 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul4bA2A432 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul4bA2A432 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul4bA2A432 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul4bA2A432 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul4bA2A432 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul4bA2A432 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul4bA2A432 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul4bA2A432 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cul4bA2A432 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cul4bA2A432 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cul4bA2A432 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cul4bA2A432 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cul4bA2A432 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul4bA2A432 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul4bA2A432 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul4bA2A432 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul4bA2A432 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul4bA2A432 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul4bA2A432 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul4bA2A432 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul4bA2A432 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul4bA2A432 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul4bA2A432 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul4bA2A432 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul4bA2A432 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul4bA2A432 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul4bA2A432 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul4bA2A432 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul4bA2A432 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul4bA2A432 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul4bA2A432 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms