Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H9

Igkv1-132, Immunoglobulin kappa variable 1-132 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Igkv1-132A0A0B4J1H9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igkv1-132A0A0B4J1H9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms