Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lgr5Q9Z1P4 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lgr5Q9Z1P4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lgr5Q9Z1P4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lgr5Q9Z1P4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lgr5Q9Z1P4 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lgr5Q9Z1P4 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lgr5Q9Z1P4 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lgr5Q9Z1P4 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lgr5Q9Z1P4 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lgr5Q9Z1P4 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lgr5Q9Z1P4 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lgr5Q9Z1P4 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lgr5Q9Z1P4 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms