Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGSF9BQ9UPX0 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IGSF9BQ9UPX0 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms