Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms