Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Phf6Q9D4J7 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Phf6Q9D4J7 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Phf6Q9D4J7 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Phf6Q9D4J7 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf6Q9D4J7 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Phf6Q9D4J7 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
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Phf6Q9D4J7 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Phf6Q9D4J7 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms