Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
USP9XQ93008 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms