Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CLN3Q13286 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CLN3Q13286 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CLN3Q13286 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN3Q13286 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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