Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BRIP1Q9BX63 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms