Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms